1964年 創立元培醫事技術專科學校

1965年 54學年度正式招生「放射技術科」、「醫務管理科」、「醫事檢驗科」

1981年 70學年度原修業五年制改為修業六年制（含實習一年）

1991年 80學年度原修業六年制改為修業五年制（含實習半年）

1991年 80年學年度成立二年制「環境工程衛生科」及「食品衛生科」

1992年 81學年度設立「護理科」

1994年 83學年度，設立二年制「醫學工程科」及「醫務管理科」

1995年 84學年度設立二年制夜間部及推廣教育中心

1999年 88學年度本校升格改制為元培科學技術學院

2000年 89學年度增設「資訊管理系」及「餐飲管理系」

2001年 食品衛生系改名為「食品科學系」

2002年 91學年度設立「資訊工程系」「企業管理系」「財務金融系」

2003年 92學年度設立「影像醫學研究所」、「生物技術研究所」及「經營管理

          研究所」

2005年 94學年度設立「生物技術系」

2006年 95學年度改名元培科技大學

          設立「應用英語系」

2007年 96學年度

設立「環境工程衛生研究所」

醫學工程系改名為「生物醫學工程系」

醫事技術系改名「醫學檢驗生物技術系」

2008年 97學年度

影像醫學研究所改名「放射技術研究所」

經營管理研究所改名「企業管理研究所」

醫事技術研究所改名「醫學檢驗生物研究所」

設立「應用保健食品研究所」、「光學科技系」

2009年98學年

應用保健食品研究所改名「食品科學研究所」

光學科技系改名「視光系」

2010年99學年

設立健康產業管理研究所

健康休閒管理系

福址科技學院

2011年100學年

設立數位創新管理研究所

生物技術系改名「生物科技系(所)」

財務金融系改名「應用財務管理系」

2012年101學年

放射技術系(所)改名「醫學影像暨放射技術系(所)」

2013年102學年

設立「醫護與福祉學院」

    「健康學院」

    「產業與管理學院」

2014年102學年

生物技術系改名「生物科技暨製藥技術系」

2014年103學年

設立「觀光與休閒管理系」

更名元培醫事科技大學

2015年104學年

醫務管理系碩士在職專班

2016年105學年

行動科技應用系(原資訊工程系)

高齡福祉事業管理學士學位學程

國際健康行銷學士學位學程

會展暨文創事業管理學士學位學程

網路與數位媒體應用學位學程